（財）がんの子供を守る会では、特定非営利活動法人日本小児がん学会事務局の委託を受けています。発足当時から積極的に支援をし、学会発展に寄与するべく活動をしています。特定非営利活動法人の概要は次の通りです。
昭和45年に（財）がんの子供を守る会の助成をもとに「小児がんセミナー」として発足し、以降、主として日本小児科学会及び日本小児外科学会の両悪性腫瘍委員会の協議により毎年実施してきた研究会を組織化、昭和59年12月に日本小児がん研究会が設立された。平成2年に日本小児がん学会として名称変更され、平成19年には特定非営利活動法人として法人格を取得し活動をしている。
この法人は、広く市民に対して、小児がん治療及び関連する領域の学術研究、広報、調査研究及び資格認定等を行うことで、我が国の小児がん医療の向上に寄与することを目的とする。
約1,400名